相关性热图常用来揭示多个变量之间的相关性,广泛应用于组学分析中。衡量相关性则就牵涉到相关性系数的计算,pearson相关系数用于捕捉变量间的线性关系,spearman相关系数用于捕捉变量之间的单调关系(单增,单减,不单调),Kendall相关系数适用于分类变量(非参数变量)的相关性分析,一般而言spearman相关系数比pearson适用性更强,两者也可以结合论证变量间的相关性,而Kendall相关系数则就只适用于定类变量的分析了。相关参考见知乎回答相关系数: Pearson vs Spearman 和Kendall相关系数详解-案例版
下面介绍origin如何绘制相关性热图,首先去官网下载一个插件Corelation Plot ,链接直达Origin File Exchange (originlab.com),下载完直接拖拽到origin到app那一个区域就好了。
导入数据
按图1所示导入数据,图2为插件自动计算相关性系数后的数据表格
绘图
全选数据点击右边app的Corelation Plot 进行绘图,选择相关系数类型,图案的排列方式,样式,显著性标记等等,可以自动预览图片。
美化
调整下字体,图例样式,热图颜色的混合方式等等
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